O Setor Universidades compõe a Comissão Episcopal Pastoral para a Cultura e a Educação da CNBB. O Setor Universidades fomenta a caminhada conjunta e a comunhão eclesial de quatro grandes forças da ação evangelizadora no Ensino Superior: PU Regionais (Pastorais Universitárias diocesanas e grupos das IES), Movimentos Eclesiais, que atuam neste âmbito, Instituições de Ensino Superior Católicas (ANEC) e Paróquias e Capelanias Universitárias. O Setor Universidades possui duas grandes linhas de atuação, a saber, formação dos agentes de pastoral e articulação da ação evangelizadora, a partir das Diretrizes Gerais da ação Evangelizadora da Igreja no Brasil (2015 – 2019).